Kauno marių regioniniame parke vykdomi tyrimai ir stebėjimai padeda geriau pažinti šią saugomą teritoriją ir taikyti efektyvesnes vertybių priežiūros, tvarkymo ir išsaugojimo priemones. Parke tyrinėjama tiek gyvoji, tiek negyvoji gamta, taip pat materialusis ir nematerialusis kultūros paveldas. Ne visus tyrimus atlieka parko specialistai: bendradarbiaujant su parko grupe, daug jų inicijuoja ir vykdo ir kitos institucijos. Tačiau kasmet atliekami šie stebėjimai ir tyrimai:
Gyvosios gamtos monitoringas